远古的时候，人们吃野草，喝生水，食用树上的野果，吃地上爬行的小虫子，所以常常生病、中毒或是受伤。神农帝为这事很犯愁，决心尝百草，定药性，为大家消灾祛病。
有一回，神农的女儿花蕊公主病了。茶不思，饭不想，浑身难受，腹胀如鼓，怎么调治也不见轻。神农就抓一些草根、树皮、野果、石头共12味，招呼花蕊公主吃下。
花蕊公主吃了那药，肚子疼得像刀绞。没大一会儿，就生下一只小鸟。这可把人吓坏了，都说是个妖怪。神农却认为这只玲珑剔透的小鸟是宝贝，还给它起个名字叫“花蕊鸟”。
神农又把花蕊公主吃过的12味药分开在锅里熬。熬一味，喂小鸟一味，一边喂，一边看，看这味药到小鸟肚里往哪走，有啥变化。
神农还亲口尝一尝，体会这味药在自己肚里是啥滋味。12味药喂完了，尝妥了，神农观察到药物一共走了手足三阴三阳十二经脉。
神农托着这只鸟上大山，钻老林，采摘各种草根、树皮、种子、果实；捕捉各种飞禽走兽、鱼鳖虾虫；挖掘各种石头矿物，一样一样地喂小鸟，一样一样地亲口尝。观察体会它们在身子里各走哪一经，各是何性，各治何病。
天长日久，神农就制订了人体的十二经脉和《本草经》。
有一次，神农手托花蕊鸟来到太行山的小北顶，捉到一只很特别的虫儿喂小鸟。没想到这虫毒气太大，一下把小鸟的肠毒断了。神农极悲痛，大哭一场。
哭过之后，选了一块上好木料，照样刻了一只鸟，走哪带哪。
后来，神农在小北顶两边的百草洼，误尝了断肠草，中毒去世了。在百草洼西北的山顶上，有一块像弯腰搂肚的人一样的石头，人们都说是神农变的。
为了纪念神农创中医、制本草，人们把小北顶改名为“神农坛”，并在神农坛上修建神农庙。庙里塑了神农像，左手托着花蕊鸟，右手拿着药正往嘴里送。
